Varnost in zaščita v okviru Evropske prostovoljske enote za humanitarno pomoč bosta zagotovljeni na treh ravneh, tako da prostovoljci nikakor ne bodo ogroženi: te tri ravni predstavljajo uredba o evropski solidarnostni enoti, ukrepi za zagotavljanje kakovosti, ki jih sprejmejo sodelujoče organizacije, in temeljita priprava prostovoljcev na njihovo napotitev. 

• Kot je določeno v uredbi, se napotitev v države, v katerih potekajo oboroženi spopadi, ne izvaja. 
• Organizacije pridobijo znak kakovosti sicer enostavneje kot akreditacijo v okviru prejšnje pobude Prostovoljci EU za humanitarno pomoč, vendar zanj obstajajo zelo stroge določbe glede sposobnosti upravljanja varnosti in zaščite prostovoljcev in bo podeljen le organizacijam, za katere se ocenjuje, da lahko v zvezi s tem dajo prepričljiva zagotovila. 
• Poleg tega je za prostovoljce posebno usposabljanje za Evropsko prostovoljsko enoto za humanitarno pomoč zelo kakovostno, z močnim poudarkom na varnosti in zaščiti, ki prostovoljcem omogoča, da se odzovejo v malo verjetnih nevarnih razmerah in ostanejo varni.